Дозорная книга 1628 года упоминает деревянную церковь во имя святителя Николая. Внешне она напоминала корабль, так как боковых приделов ещё не существовало. Описание тех лет рисует образ довольно богатого храма: «Деревянный верх, а в церкви деисус, и двери царския, и образы местныя, и ризы, и свечи, и колокола, и всякое церковное строение – мирское».
Точная дата постройки первого храма неизвестна. В 1684 году была возведена новая деревянная церковь, простоявшая до 1821 года.
Современный каменный Свято-Никольский храм — это уже третье здание. Он был построен после Отечественной войны 1812 года, в 1821 году, в стиле позднего классицизма. Ещё до его возведения, в 1818 году, освятили Алексеевский придел (в честь святителя Алексия), а позднее и Сергиевский (в честь преподобного Сергия Радонежского).
Уникальность архитектуры этого храма заключается в том, что его огромный свод держится без опорных колонн, что свидетельствует о высоком мастерстве зодчих и особой технологии строительства.
В 1820 году на средства дворянина Е.Н. Соленикова была возведена колокольня и отлит колокол весом в 365 пудов. Позже появились и другие колокола: 200-пудовый (от С.И. Ванякина), 150-пудовый (от Вяземского), 175-пудовый и несколько малых колоколов (от фабриканта Кольчугина).
Конец XIX века стал временем значительного расширения храма. Яков Никитич Евдокимов, желая помянуть душу умершего брата, пожертвовал миллион кирпичей со своего завода и 75 тысяч рублей. В результате были построены два придела, а площадь храма увеличилась втрое. Свято-Никольский храм обрёл форму креста, в которой пребывает и поныне. В начале XX века он был одним из известнейших храмов Киржачского района, а напротив него, на улице, называемой в народе «поповкой», жили священнослужители.